教学机构
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- 国际教育新宝2（外事办公室）
管理机构
- 党政办公室
- 纪委监察专员办公室
- 党委组织部（党校）
- 党委宣传部
- 党委统战部
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- 团委
- 人事处（党委人才工作部）
- 教务处
- 研究生处
- 发展规划处
- 科学技术处
- 财务处
- 审计处
- 学生工作处（党委学生工作部、武装部）
- 招生就业处
- 校园安全管理处
- 国有资产管理处
- 后勤管理处
- 离退休工作处
教辅机构
- 牙克石农林实验实训中心
- 教师发展中心（党委教师工作部）
- 图书馆
- 学报编辑部
- 网络中心
- 民族历史文献研究中心
- 铸牢中华民族共同体意识研究中心
- 乡村振兴研究中心
- 实验实训室管理中心
科研机构与平台
- 俄罗斯东西伯利亚及远东民族语言文化研究中心
- 矿产资源安全开采与综合利用工程研究中心
- 内蒙古自治区铸牢中华民族共同体意识研究基地（培育）
- 《元朝秘史》国际研究基地
- 呼伦贝尔历史文化遗产与中华民族交往交流交融研究基地
- 呼伦贝尔民族历史文化研究基地
- 呼伦贝尔市铸牢中华民族共同体意识研究基地
- 呼伦贝尔市北疆文化研究基地